Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
USP18Q9UMW8 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
USP18Q9UMW8 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.29
USP18Q9UMW8 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
USP18Q9UMW8 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
USP18Q9UMW8 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
USP18Q9UMW8 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
USP18Q9UMW8 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
USP18Q9UMW8 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
USP18Q9UMW8 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
USP18Q9UMW8 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
USP18Q9UMW8 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
USP18Q9UMW8 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
USP18Q9UMW8 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
USP18Q9UMW8 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
USP18Q9UMW8 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
USP18Q9UMW8 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
USP18Q9UMW8 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
USP18Q9UMW8 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
USP18Q9UMW8 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
USP18Q9UMW8 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
USP18Q9UMW8 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
USP18Q9UMW8 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
USP18Q9UMW8 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
USP18Q9UMW8 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
USP18Q9UMW8 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.74□□□□□ -2.29
USP18Q9UMW8 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.3 ms