Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
RRN3Q9NYV6 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
RRN3Q9NYV6 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
RRN3Q9NYV6 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
RRN3Q9NYV6 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
RRN3Q9NYV6 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
RRN3Q9NYV6 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
RRN3Q9NYV6 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
RRN3Q9NYV6 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
RRN3Q9NYV6 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
RRN3Q9NYV6 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
RRN3Q9NYV6 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
RRN3Q9NYV6 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
RRN3Q9NYV6 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
RRN3Q9NYV6 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
RRN3Q9NYV6 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
RRN3Q9NYV6 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
RRN3Q9NYV6 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
RRN3Q9NYV6 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
RRN3Q9NYV6 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
RRN3Q9NYV6 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
RRN3Q9NYV6 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
RRN3Q9NYV6 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
RRN3Q9NYV6 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
RRN3Q9NYV6 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
RRN3Q9NYV6 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
RRN3Q9NYV6 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
RRN3Q9NYV6 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
RRN3Q9NYV6 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
RRN3Q9NYV6 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
RRN3Q9NYV6 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
RRN3Q9NYV6 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RRN3Q9NYV6 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RRN3Q9NYV6 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RRN3Q9NYV6 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RRN3Q9NYV6 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RRN3Q9NYV6 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
RRN3Q9NYV6 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
RRN3Q9NYV6 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
RRN3Q9NYV6 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
RRN3Q9NYV6 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RRN3Q9NYV6 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RRN3Q9NYV6 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RRN3Q9NYV6 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RRN3Q9NYV6 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RRN3Q9NYV6 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RRN3Q9NYV6 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RRN3Q9NYV6 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
RRN3Q9NYV6 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
RRN3Q9NYV6 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
RRN3Q9NYV6 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
RRN3Q9NYV6 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
RRN3Q9NYV6 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
RRN3Q9NYV6 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.8 ms