Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
ATRQ13535 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
ATRQ13535 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ATRQ13535 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ATRQ13535 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ATRQ13535 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ATRQ13535 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ATRQ13535 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ATRQ13535 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ATRQ13535 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ATRQ13535 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ATRQ13535 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ATRQ13535 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ATRQ13535 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ATRQ13535 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ATRQ13535 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ATRQ13535 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ATRQ13535 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ATRQ13535 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ATRQ13535 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ATRQ13535 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ATRQ13535 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ATRQ13535 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ATRQ13535 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ATRQ13535 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ATRQ13535 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ATRQ13535 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATRQ13535 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATRQ13535 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATRQ13535 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATRQ13535 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATRQ13535 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATRQ13535 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATRQ13535 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATRQ13535 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATRQ13535 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATRQ13535 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATRQ13535 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATRQ13535 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATRQ13535 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATRQ13535 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATRQ13535 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATRQ13535 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATRQ13535 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ATRQ13535 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATRQ13535 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATRQ13535 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATRQ13535 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATRQ13535 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATRQ13535 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATRQ13535 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATRQ13535 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATRQ13535 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATRQ13535 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATRQ13535 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATRQ13535 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATRQ13535 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATRQ13535 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATRQ13535 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ATRQ13535 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
ATRQ13535 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
ATRQ13535 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
ATRQ13535 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
ATRQ13535 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
ATRQ13535 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC-1.66□□□□□ -2.68
ATRQ13535 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
ATRQ13535 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
ATRQ13535 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
ATRQ13535 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
ATRQ13535 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
ATRQ13535 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
ATRQ13535 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ATRQ13535 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ATRQ13535 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ATRQ13535 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ATRQ13535 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ATRQ13535 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ATRQ13535 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ATRQ13535 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ATRQ13535 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ATRQ13535 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ATRQ13535 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ATRQ13535 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ATRQ13535 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ATRQ13535 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ATRQ13535 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ATRQ13535 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ATRQ13535 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ATRQ13535 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ATRQ13535 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ATRQ13535 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ATRQ13535 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC-1.68□□□□□ -2.68
ATRQ13535 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ATRQ13535 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ATRQ13535 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ATRQ13535 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ATRQ13535 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC-1.68□□□□□ -2.68
ATRQ13535 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ATRQ13535 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ATRQ13535 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
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