Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN8

CLEC9A, C-type lectin domain family 9 member A, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC9AQ6UXN8 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CLEC9AQ6UXN8 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CLEC9AQ6UXN8 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CLEC9AQ6UXN8 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CLEC9AQ6UXN8 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CLEC9AQ6UXN8 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CLEC9AQ6UXN8 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CLEC9AQ6UXN8 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
CLEC9AQ6UXN8 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
CLEC9AQ6UXN8 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CLEC9AQ6UXN8 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CLEC9AQ6UXN8 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CLEC9AQ6UXN8 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CLEC9AQ6UXN8 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CLEC9AQ6UXN8 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 226.4 ms