Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FXNQ16595 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FXNQ16595 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
FXNQ16595 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FXNQ16595 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FXNQ16595 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FXNQ16595 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
FXNQ16595 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
FXNQ16595 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
FXNQ16595 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
FXNQ16595 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
FXNQ16595 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
FXNQ16595 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
FXNQ16595 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
FXNQ16595 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FXNQ16595 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FXNQ16595 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FXNQ16595 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
FXNQ16595 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
FXNQ16595 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
FXNQ16595 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
FXNQ16595 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
FXNQ16595 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
FXNQ16595 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
FXNQ16595 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
FXNQ16595 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
FXNQ16595 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
FXNQ16595 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
FXNQ16595 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
FXNQ16595 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
FXNQ16595 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FXNQ16595 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FXNQ16595 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FXNQ16595 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FXNQ16595 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
FXNQ16595 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
FXNQ16595 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FXNQ16595 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
FXNQ16595 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
FXNQ16595 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FXNQ16595 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FXNQ16595 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FXNQ16595 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FXNQ16595 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FXNQ16595 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FXNQ16595 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FXNQ16595 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
FXNQ16595 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
FXNQ16595 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
FXNQ16595 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
FXNQ16595 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
FXNQ16595 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
FXNQ16595 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
FXNQ16595 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
FXNQ16595 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
FXNQ16595 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
FXNQ16595 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
FXNQ16595 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
FXNQ16595 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
FXNQ16595 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
FXNQ16595 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
FXNQ16595 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
FXNQ16595 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
FXNQ16595 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
FXNQ16595 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
FXNQ16595 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
FXNQ16595 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
FXNQ16595 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
FXNQ16595 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
FXNQ16595 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
FXNQ16595 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
FXNQ16595 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
FXNQ16595 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
FXNQ16595 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
FXNQ16595 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
FXNQ16595 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
FXNQ16595 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
FXNQ16595 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
FXNQ16595 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
FXNQ16595 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
FXNQ16595 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
FXNQ16595 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
FXNQ16595 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
FXNQ16595 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
FXNQ16595 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
FXNQ16595 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
FXNQ16595 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
FXNQ16595 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
FXNQ16595 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
FXNQ16595 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
FXNQ16595 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
FXNQ16595 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
FXNQ16595 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
FXNQ16595 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
FXNQ16595 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
FXNQ16595 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
FXNQ16595 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
FXNQ16595 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
FXNQ16595 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
FXNQ16595 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.2 ms