Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
KARSQ15046 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
KARSQ15046 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
KARSQ15046 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
KARSQ15046 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
KARSQ15046 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
KARSQ15046 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
KARSQ15046 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
KARSQ15046 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
KARSQ15046 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
KARSQ15046 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
KARSQ15046 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
KARSQ15046 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
KARSQ15046 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
KARSQ15046 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
KARSQ15046 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
KARSQ15046 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
KARSQ15046 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
KARSQ15046 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
KARSQ15046 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
KARSQ15046 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
KARSQ15046 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
KARSQ15046 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
KARSQ15046 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
KARSQ15046 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
KARSQ15046 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
KARSQ15046 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
KARSQ15046 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
KARSQ15046 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
KARSQ15046 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
KARSQ15046 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
KARSQ15046 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
KARSQ15046 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
KARSQ15046 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
KARSQ15046 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
KARSQ15046 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
KARSQ15046 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
KARSQ15046 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
KARSQ15046 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
KARSQ15046 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
KARSQ15046 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
KARSQ15046 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
KARSQ15046 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
KARSQ15046 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
KARSQ15046 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
KARSQ15046 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
KARSQ15046 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
KARSQ15046 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
KARSQ15046 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
KARSQ15046 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
KARSQ15046 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
KARSQ15046 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
KARSQ15046 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
KARSQ15046 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
KARSQ15046 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
KARSQ15046 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
KARSQ15046 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
KARSQ15046 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
KARSQ15046 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
KARSQ15046 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
KARSQ15046 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
KARSQ15046 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
KARSQ15046 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
KARSQ15046 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
KARSQ15046 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
KARSQ15046 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
KARSQ15046 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
KARSQ15046 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
KARSQ15046 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
KARSQ15046 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
KARSQ15046 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
KARSQ15046 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
KARSQ15046 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
KARSQ15046 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
KARSQ15046 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
KARSQ15046 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
KARSQ15046 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
KARSQ15046 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
KARSQ15046 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
KARSQ15046 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
KARSQ15046 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
KARSQ15046 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
KARSQ15046 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
KARSQ15046 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
KARSQ15046 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
KARSQ15046 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
KARSQ15046 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
KARSQ15046 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
KARSQ15046 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
KARSQ15046 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
KARSQ15046 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
KARSQ15046 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
KARSQ15046 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
KARSQ15046 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
KARSQ15046 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
KARSQ15046 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
KARSQ15046 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
KARSQ15046 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
KARSQ15046 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
KARSQ15046 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 214.1 ms