Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
HERPUD1Q15011 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.02□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HERPUD1Q15011 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERPUD1Q15011 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HERPUD1Q15011 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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