Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SCN5AQ14524 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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SCN5AQ14524 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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SCN5AQ14524 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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