Protein–RNA interactions for Protein: Q13454

TUSC3, Tumor suppressor candidate 3, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC3Q13454 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
TUSC3Q13454 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TUSC3Q13454 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TUSC3Q13454 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 392 ms