Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTP4A2Q12974 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PTP4A2Q12974 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTP4A2Q12974 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTP4A2Q12974 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTP4A2Q12974 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTP4A2Q12974 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTP4A2Q12974 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTP4A2Q12974 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTP4A2Q12974 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTP4A2Q12974 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PTP4A2Q12974 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PTP4A2Q12974 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTP4A2Q12974 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202 ms