Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
HOXA4Q00056 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.26
HOXA4Q00056 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
HOXA4Q00056 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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