Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VPREB1P12018 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VPREB1P12018 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
VPREB1P12018 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
VPREB1P12018 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
VPREB1P12018 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186 ms