Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LHX9Q9NQ69 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LHX9Q9NQ69 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LHX9Q9NQ69 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LHX9Q9NQ69 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LHX9Q9NQ69 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LHX9Q9NQ69 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LHX9Q9NQ69 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LHX9Q9NQ69 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LHX9Q9NQ69 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LHX9Q9NQ69 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LHX9Q9NQ69 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LHX9Q9NQ69 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LHX9Q9NQ69 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LHX9Q9NQ69 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LHX9Q9NQ69 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LHX9Q9NQ69 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LHX9Q9NQ69 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LHX9Q9NQ69 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LHX9Q9NQ69 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LHX9Q9NQ69 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LHX9Q9NQ69 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
LHX9Q9NQ69 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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LHX9Q9NQ69 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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LHX9Q9NQ69 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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LHX9Q9NQ69 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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LHX9Q9NQ69 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
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LHX9Q9NQ69 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LHX9Q9NQ69 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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LHX9Q9NQ69 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LHX9Q9NQ69 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
LHX9Q9NQ69 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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LHX9Q9NQ69 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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LHX9Q9NQ69 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
LHX9Q9NQ69 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
LHX9Q9NQ69 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
LHX9Q9NQ69 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
LHX9Q9NQ69 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
LHX9Q9NQ69 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
LHX9Q9NQ69 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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LHX9Q9NQ69 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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