Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SFT2D3Q587I9 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-0.63□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
SFT2D3Q587I9 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 268.2 ms