Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
RAPGEF1Q13905 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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