Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ALCAMQ13740 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ALCAMQ13740 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
ALCAMQ13740 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ALCAMQ13740 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ALCAMQ13740 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ALCAMQ13740 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ALCAMQ13740 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ALCAMQ13740 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ALCAMQ13740 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ALCAMQ13740 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ALCAMQ13740 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ALCAMQ13740 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ALCAMQ13740 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
ALCAMQ13740 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ALCAMQ13740 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.8 ms