Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
CKAP4Q07065 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CKAP4Q07065 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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