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Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6
OPN4, Melanopsin, human
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
OPN4
Q9UHM6
RNU6ATAC4P-201
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126 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
RNA5SP299-201
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116 nt
BASIC
0.14
□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
RNU6-394P-201
ENST00000410735
107 nt
BASIC
0.14
□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
AC069271.1-201
ENST00000445577
156 nt
BASIC
0.14
□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.692-201
ENST00000516627
105 nt
BASIC
0.14
□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
MIR3121-201
ENST00000579680
77 nt
BASIC
0.14
□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
MIR548H5-201
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BASIC
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□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
TUG1_4.1-201
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181 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.49-201
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112 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
SNORD115-24-201
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82 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.270-201
ENST00000364693
104 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
RNU6-804P-201
ENST00000384286
107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
MIR1295A-201
ENST00000408463
79 nt
BASIC
0.13
□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
RNU7-2P-201
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62 nt
BASIC
0.13
□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
AC138869.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
FTX_2.1-201
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94 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
AP001362.1-201
ENST00000625165
124 nt
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□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.98-201
ENST00000363109
102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
RNU6-865P-201
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BASIC
0.12
□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.398-201
ENST00000383952
99 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
RNU6-1126P-201
ENST00000384002
107 nt
BASIC
0.12
□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
RNU6-815P-201
ENST00000384080
113 nt
BASIC
0.12
□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
RNU6-616P-201
ENST00000384353
107 nt
BASIC
0.12
□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
AC244505.6-201
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130 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
AC069113.3-201
ENST00000521019
150 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
AP001328.1-201
ENST00000528550
176 nt
BASIC
0.12
□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
MIR3144-201
ENST00000579460
79 nt
BASIC
0.12
□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
MIR4500-201
ENST00000579472
76 nt
BASIC
0.12
□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
MIR548X2-201
ENST00000579776
100 nt
BASIC
0.12
□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
RNU7-10P-201
ENST00000607194
63 nt
BASIC
0.12
□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.150-201
ENST00000363562
102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.423-201
ENST00000384057
113 nt
BASIC
0.11
□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
RNU6-187P-201
ENST00000384139
106 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
RNU6-1307P-201
ENST00000391012
103 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
PCNPP3-201
ENST00000393579
471 nt
BASIC
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OPN4
Q9UHM6
IGKV1-22-201
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BASIC
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□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
AC090425.1-201
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140 nt
BASIC
0.11
□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
MIR6755-201
ENST00000619993
66 nt
BASIC
0.11
□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
AP001340.1-201
ENST00000624405
217 nt
BASIC
0.11
□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.114-201
ENST00000363265
113 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.127-201
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
RNU6-647P-201
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
SNORD115-35-201
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BASIC
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□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.328-201
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113 nt
BASIC
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□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.400-201
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111 nt
BASIC
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OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.420-201
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110 nt
BASIC
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Q9UHM6
RNU6-886P-201
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
MIR635-201
ENST00000384830
98 nt
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OPN4
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MIR548L-201
ENST00000408303
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Q9UHM6
RNU7-6P-201
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
MIR4315-1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.39
OPN4
Q9UHM6
MIR4315-2-201
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
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OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.294-201
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
MIR569-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
BX276092.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
RNU7-104P-201
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
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OPN4
Q9UHM6
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BASIC
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Q9UHM6
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
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BASIC
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OPN4
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OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.213-201
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OPN4
Q9UHM6
RNU6-726P-201
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BASIC
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MIR599-201
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BASIC
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Q9UHM6
MT-TI-201
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
MIR1263-201
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
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OPN4
Q9UHM6
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BASIC
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Q9UHM6
RNU7-129P-201
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
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BASIC
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□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
MTND5P41-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
MIR4752-201
ENST00000579672
72 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
U7.2-201
ENST00000607576
63 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
KIF20B-201
ENST00000260753
6306 nt
APPRIS P3
TSL 1 (best)
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
SNORD115-19-201
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82 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
SNORD115-18-201
ENST00000363293
82 nt
BASIC
0.07
□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
RNA5SP403-201
ENST00000363598
108 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.198-201
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98 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.221-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
SNORD115-17-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.280-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
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BASIC
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□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
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BASIC
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□□□□□ -2.4
OPN4
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BASIC
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BASIC
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BASIC
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□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
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80 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
SNORA2A-201
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135 nt
BASIC
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OPN4
Q9UHM6
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ENST00000384831
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BASIC
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AL158147.1-201
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OPN4
Q9UHM6
RNU6-521P-201
ENST00000516663
105 nt
BASIC
0.06
□□□□□ -2.4
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