Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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LHX9Q9NQ69 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.4
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LHX9Q9NQ69 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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LHX9Q9NQ69 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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LHX9Q9NQ69 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LHX9Q9NQ69 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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LHX9Q9NQ69 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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LHX9Q9NQ69 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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LHX9Q9NQ69 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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LHX9Q9NQ69 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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LHX9Q9NQ69 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LHX9Q9NQ69 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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