Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
NLRP1Q9C000 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
NLRP1Q9C000 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
NLRP1Q9C000 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
NLRP1Q9C000 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
NLRP1Q9C000 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
NLRP1Q9C000 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
NLRP1Q9C000 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.52□□□□□ -2.81
NLRP1Q9C000 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-2.52□□□□□ -2.81
NLRP1Q9C000 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
NLRP1Q9C000 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
NLRP1Q9C000 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
NLRP1Q9C000 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
NLRP1Q9C000 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
NLRP1Q9C000 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
NLRP1Q9C000 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
NLRP1Q9C000 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
NLRP1Q9C000 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
NLRP1Q9C000 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC-2.53□□□□□ -2.81
NLRP1Q9C000 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
NLRP1Q9C000 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
NLRP1Q9C000 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
NLRP1Q9C000 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
NLRP1Q9C000 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-2.54□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.56□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-2.58□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC-2.59□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
NLRP1Q9C000 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
NLRP1Q9C000 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
NLRP1Q9C000 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
NLRP1Q9C000 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
NLRP1Q9C000 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
NLRP1Q9C000 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
NLRP1Q9C000 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
NLRP1Q9C000 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-2.61□□□□□ -2.83
NLRP1Q9C000 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
NLRP1Q9C000 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
NLRP1Q9C000 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
NLRP1Q9C000 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
NLRP1Q9C000 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
NLRP1Q9C000 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
NLRP1Q9C000 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
NLRP1Q9C000 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
NLRP1Q9C000 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
NLRP1Q9C000 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
NLRP1Q9C000 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
NLRP1Q9C000 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
NLRP1Q9C000 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
NLRP1Q9C000 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
NLRP1Q9C000 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
NLRP1Q9C000 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
NLRP1Q9C000 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
NLRP1Q9C000 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
NLRP1Q9C000 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
NLRP1Q9C000 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
NLRP1Q9C000 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
NLRP1Q9C000 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
NLRP1Q9C000 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
NLRP1Q9C000 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
NLRP1Q9C000 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms