Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SSX1Q16384 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SSX1Q16384 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SSX1Q16384 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SSX1Q16384 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SSX1Q16384 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SSX1Q16384 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SSX1Q16384 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SSX1Q16384 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SSX1Q16384 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SSX1Q16384 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SSX1Q16384 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SSX1Q16384 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
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SSX1Q16384 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
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SSX1Q16384 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
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SSX1Q16384 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
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SSX1Q16384 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SSX1Q16384 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SSX1Q16384 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SSX1Q16384 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SSX1Q16384 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SSX1Q16384 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
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SSX1Q16384 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
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SSX1Q16384 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SSX1Q16384 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SSX1Q16384 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SSX1Q16384 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SSX1Q16384 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SSX1Q16384 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SSX1Q16384 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SSX1Q16384 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SSX1Q16384 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SSX1Q16384 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
SSX1Q16384 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
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