Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CCDC85BQ15834 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCDC85BQ15834 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
CCDC85BQ15834 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.2 ms