Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
HERPUD1Q15011 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HERPUD1Q15011 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HERPUD1Q15011 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
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