Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
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HOXC5Q00444 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
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HOXC5Q00444 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
HOXC5Q00444 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
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HOXC5Q00444 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
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HOXC5Q00444 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
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HOXC5Q00444 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
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