Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
LRRTM2O43300 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
LRRTM2O43300 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
LRRTM2O43300 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
LRRTM2O43300 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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