Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNNM1Q9NRU3 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNNM1Q9NRU3 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNNM1Q9NRU3 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CNNM1Q9NRU3 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNNM1Q9NRU3 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNNM1Q9NRU3 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNNM1Q9NRU3 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNNM1Q9NRU3 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNNM1Q9NRU3 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNNM1Q9NRU3 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNNM1Q9NRU3 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNNM1Q9NRU3 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNNM1Q9NRU3 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNNM1Q9NRU3 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNNM1Q9NRU3 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNNM1Q9NRU3 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNNM1Q9NRU3 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
CNNM1Q9NRU3 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNNM1Q9NRU3 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNNM1Q9NRU3 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNNM1Q9NRU3 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNNM1Q9NRU3 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
CNNM1Q9NRU3 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNNM1Q9NRU3 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNNM1Q9NRU3 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
CNNM1Q9NRU3 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
CNNM1Q9NRU3 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNNM1Q9NRU3 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNNM1Q9NRU3 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNNM1Q9NRU3 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNNM1Q9NRU3 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNNM1Q9NRU3 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNNM1Q9NRU3 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNNM1Q9NRU3 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNNM1Q9NRU3 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CNNM1Q9NRU3 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNNM1Q9NRU3 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CNNM1Q9NRU3 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.1 ms