Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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TRERF1Q96PN7 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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TRERF1Q96PN7 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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TRERF1Q96PN7 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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TRERF1Q96PN7 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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TRERF1Q96PN7 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRERF1Q96PN7 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TRERF1Q96PN7 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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TRERF1Q96PN7 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRERF1Q96PN7 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRERF1Q96PN7 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TRERF1Q96PN7 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRERF1Q96PN7 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRERF1Q96PN7 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRERF1Q96PN7 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRERF1Q96PN7 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TRERF1Q96PN7 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRERF1Q96PN7 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRERF1Q96PN7 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRERF1Q96PN7 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRERF1Q96PN7 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRERF1Q96PN7 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRERF1Q96PN7 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRERF1Q96PN7 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRERF1Q96PN7 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRERF1Q96PN7 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TRERF1Q96PN7 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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