Protein–RNA interactions for Protein: Q96M19

LINC00477, Putative transmembrane protein encoded by LINC00477, humanhuman

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00477Q96M19 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
LINC00477Q96M19 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
LINC00477Q96M19 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
LINC00477Q96M19 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
LINC00477Q96M19 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
LINC00477Q96M19 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
LINC00477Q96M19 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
LINC00477Q96M19 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
LINC00477Q96M19 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
LINC00477Q96M19 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
LINC00477Q96M19 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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LINC00477Q96M19 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
LINC00477Q96M19 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
LINC00477Q96M19 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
LINC00477Q96M19 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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LINC00477Q96M19 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
LINC00477Q96M19 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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LINC00477Q96M19 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
LINC00477Q96M19 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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LINC00477Q96M19 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
LINC00477Q96M19 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
LINC00477Q96M19 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
LINC00477Q96M19 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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LINC00477Q96M19 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
LINC00477Q96M19 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
LINC00477Q96M19 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
LINC00477Q96M19 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
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LINC00477Q96M19 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
LINC00477Q96M19 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
LINC00477Q96M19 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
LINC00477Q96M19 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
LINC00477Q96M19 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
LINC00477Q96M19 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
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LINC00477Q96M19 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
LINC00477Q96M19 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
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LINC00477Q96M19 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LINC00477Q96M19 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
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LINC00477Q96M19 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LINC00477Q96M19 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LINC00477Q96M19 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LINC00477Q96M19 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
LINC00477Q96M19 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
LINC00477Q96M19 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
LINC00477Q96M19 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
LINC00477Q96M19 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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