Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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BEST4Q8NFU0 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
BEST4Q8NFU0 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
BEST4Q8NFU0 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
BEST4Q8NFU0 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
BEST4Q8NFU0 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
BEST4Q8NFU0 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
BEST4Q8NFU0 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
BEST4Q8NFU0 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
BEST4Q8NFU0 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
BEST4Q8NFU0 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
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BEST4Q8NFU0 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
BEST4Q8NFU0 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
BEST4Q8NFU0 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
BEST4Q8NFU0 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
BEST4Q8NFU0 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
BEST4Q8NFU0 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
BEST4Q8NFU0 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
BEST4Q8NFU0 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
BEST4Q8NFU0 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
BEST4Q8NFU0 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
BEST4Q8NFU0 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
BEST4Q8NFU0 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
BEST4Q8NFU0 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
BEST4Q8NFU0 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
BEST4Q8NFU0 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
BEST4Q8NFU0 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
BEST4Q8NFU0 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BEST4Q8NFU0 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BEST4Q8NFU0 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BEST4Q8NFU0 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BEST4Q8NFU0 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BEST4Q8NFU0 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BEST4Q8NFU0 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BEST4Q8NFU0 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BEST4Q8NFU0 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BEST4Q8NFU0 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
BEST4Q8NFU0 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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BEST4Q8NFU0 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
BEST4Q8NFU0 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
BEST4Q8NFU0 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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BEST4Q8NFU0 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
BEST4Q8NFU0 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
BEST4Q8NFU0 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
BEST4Q8NFU0 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
BEST4Q8NFU0 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
BEST4Q8NFU0 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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