Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.78□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
CAPRIN1Q14444 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CAPRIN1Q14444 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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