Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RAPGEF1Q13905 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
RAPGEF1Q13905 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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