Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
CHAF1AQ13111 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
CHAF1AQ13111 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 281.7 ms