Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
BNIP1Q12981 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
BNIP1Q12981 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
BNIP1Q12981 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
BNIP1Q12981 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
BNIP1Q12981 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
BNIP1Q12981 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
BNIP1Q12981 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
BNIP1Q12981 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
BNIP1Q12981 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
BNIP1Q12981 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
BNIP1Q12981 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
BNIP1Q12981 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
BNIP1Q12981 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC0□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC0□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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BNIP1Q12981 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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BNIP1Q12981 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
BNIP1Q12981 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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BNIP1Q12981 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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BNIP1Q12981 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
BNIP1Q12981 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
BNIP1Q12981 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
BNIP1Q12981 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.04□□□□□ -2.42
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BNIP1Q12981 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
BNIP1Q12981 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
BNIP1Q12981 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
BNIP1Q12981 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
BNIP1Q12981 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
BNIP1Q12981 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
BNIP1Q12981 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
BNIP1Q12981 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
BNIP1Q12981 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
BNIP1Q12981 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
BNIP1Q12981 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
BNIP1Q12981 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
BNIP1Q12981 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
BNIP1Q12981 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
BNIP1Q12981 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
BNIP1Q12981 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
BNIP1Q12981 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
BNIP1Q12981 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
BNIP1Q12981 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
BNIP1Q12981 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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