Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
LMAN2Q12907 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LMAN2Q12907 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LMAN2Q12907 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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