Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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GTF3C1Q12789 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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GTF3C1Q12789 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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GTF3C1Q12789 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GTF3C1Q12789 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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