Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXC8P31273 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC8P31273 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.4 ms