Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0□□□□□ -2.41
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0□□□□□ -2.41
COPS7AQ9UBW8 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
COPS7AQ9UBW8 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
COPS7AQ9UBW8 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0□□□□□ -2.41
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
COPS7AQ9UBW8 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
COPS7AQ9UBW8 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
COPS7AQ9UBW8 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
COPS7AQ9UBW8 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
COPS7AQ9UBW8 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
COPS7AQ9UBW8 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
COPS7AQ9UBW8 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
COPS7AQ9UBW8 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
COPS7AQ9UBW8 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COPS7AQ9UBW8 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COPS7AQ9UBW8 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COPS7AQ9UBW8 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
COPS7AQ9UBW8 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
COPS7AQ9UBW8 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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COPS7AQ9UBW8 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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COPS7AQ9UBW8 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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COPS7AQ9UBW8 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
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COPS7AQ9UBW8 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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COPS7AQ9UBW8 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
COPS7AQ9UBW8 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
COPS7AQ9UBW8 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
COPS7AQ9UBW8 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
COPS7AQ9UBW8 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
COPS7AQ9UBW8 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
COPS7AQ9UBW8 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
COPS7AQ9UBW8 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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