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| EHD3 | Q9NZN3 | MIR3613-201 | ENST00000579844 | 87 nt | BASIC | 1.3 | □□□□□ -2.2 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | UBE3A-225 | ENST00000636667 | 5726 nt | TSL 5 BASIC | 1.29 | □□□□□ -2.2 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | SNORD114-10-201 | ENST00000363409 | 72 nt | BASIC | 1.29 | □□□□□ -2.2 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | Y_RNA.168-201 | ENST00000363740 | 102 nt | BASIC | 1.29 | □□□□□ -2.2 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | Y_RNA.328-201 | ENST00000365208 | 113 nt | BASIC | 1.29 | □□□□□ -2.2 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | Y_RNA.448-201 | ENST00000384185 | 108 nt | BASIC | 1.29 | □□□□□ -2.2 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | MIR577-201 | ENST00000385196 | 96 nt | BASIC | 1.29 | □□□□□ -2.2 | | |
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| EHD3 | Q9NZN3 | AC012668.1-201 | ENST00000457625 | 228 nt | TSL 3 BASIC | 1.27 | □□□□□ -2.21 | | |
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| EHD3 | Q9NZN3 | ABCA5-201 | ENST00000392676 | 8220 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | SNORD113.3-201 | ENST00000364630 | 78 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
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| EHD3 | Q9NZN3 | ZNF468-202 | ENST00000396409 | 384 nt | TSL 5 BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | SNORD83.1-201 | ENST00000411362 | 77 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | AC096949.1-201 | ENST00000412047 | 152 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | AC015818.7-201 | ENST00000428754 | 109 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | AC087499.7-201 | ENST00000441958 | 109 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | UBL5P1-201 | ENST00000507979 | 193 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | RNU6-109P-201 | ENST00000516364 | 107 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | RNU6-184P-201 | ENST00000516514 | 107 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | AC009093.3-203 | ENST00000565800 | 121 nt | TSL 2 BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | MIR376B-201 | ENST00000614515 | 100 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | AC012676.2-201 | ENST00000619258 | 186 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | AC008163.1-202 | ENST00000636004 | 2889 nt | BASIC | 1.26 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | RNU6-1313P-201 | ENST00000362622 | 102 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | RNY3P2-201 | ENST00000362918 | 102 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | RNU6-1201P-201 | ENST00000384227 | 107 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | Y_RNA.495-201 | ENST00000384435 | 112 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | MT-TF-201 | ENST00000387314 | 71 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | RNA5SP89-201 | ENST00000410300 | 108 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | MRPL35P3-201 | ENST00000421557 | 364 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | RNU1-123P-201 | ENST00000458950 | 160 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | RNU6-237P-201 | ENST00000515985 | 71 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | RNU6-904P-201 | ENST00000516206 | 101 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | RNU6-1018P-201 | ENST00000516577 | 106 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | SNORA70.22-201 | ENST00000517160 | 124 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | DEFB131E-201 | ENST00000532329 | 154 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | MIR4421-201 | ENST00000578133 | 69 nt | BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | TDRD15-202 | ENST00000622654 | 5805 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.25 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | RNU6-832P-201 | ENST00000363319 | 107 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | Y_RNA.247-201 | ENST00000364500 | 92 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | RNU6-865P-201 | ENST00000364772 | 107 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | RNU6-32P-201 | ENST00000383948 | 107 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | RNU6-13P-201 | ENST00000384248 | 107 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | RNU6-12P-201 | ENST00000384604 | 107 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
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| EHD3 | Q9NZN3 | AP1B1P2-201 | ENST00000416196 | 106 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | RNU7-48P-201 | ENST00000458875 | 63 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | RNU6-168P-201 | ENST00000516189 | 101 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | RNU6-537P-201 | ENST00000517277 | 103 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | AC133485.1-201 | ENST00000567176 | 124 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | AC106800.4-201 | ENST00000614905 | 153 nt | BASIC | 1.24 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | C9orf84-201 | ENST00000318737 | 4661 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | Y_RNA.78-201 | ENST00000362970 | 110 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | RNU6-1113P-201 | ENST00000384348 | 107 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | MIR222-201 | ENST00000384992 | 110 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | RNU6-447P-201 | ENST00000410293 | 104 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | RNU6-1118P-201 | ENST00000410382 | 104 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | RNU6-1076P-201 | ENST00000410397 | 104 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | RNU6-355P-201 | ENST00000410427 | 104 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | RNU6-791P-201 | ENST00000410467 | 104 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | RNU6-705P-201 | ENST00000410601 | 104 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | RNU6-1100P-201 | ENST00000410691 | 104 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | RNU6-860P-201 | ENST00000410860 | 104 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | RNU6-1217P-201 | ENST00000411276 | 104 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | RNU6-785P-201 | ENST00000411324 | 104 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | MIR18B-201 | ENST00000454574 | 71 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | RNU7-90P-201 | ENST00000459216 | 62 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | AC004223.1-201 | ENST00000479840 | 271 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | AC108729.3-201 | ENST00000513484 | 108 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | AC068338.1-201 | ENST00000565567 | 176 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | MIR3660-201 | ENST00000584845 | 100 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | U6.90-201 | ENST00000614007 | 104 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | U6.70-201 | ENST00000620287 | 104 nt | BASIC | 1.23 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | AC023934.1-201 | ENST00000574529 | 2389 nt | BASIC | 1.22 | □□□□□ -2.21 | | |
| EHD3 | Q9NZN3 | SNORA7.1-201 | ENST00000363750 | 139 nt | BASIC | 1.22 | □□□□□ -2.21 | | |