Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TRERF1Q96PN7 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TRERF1Q96PN7 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TRERF1Q96PN7 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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