Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
CCDC47Q96A33 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.56□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
CCDC47Q96A33 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CCDC47Q96A33 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.66□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CCDC47Q96A33 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
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