Protein–RNA interactions for Protein: Q70JA7

CHSY3, Chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3Q70JA7 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CHSY3Q70JA7 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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CHSY3Q70JA7 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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CHSY3Q70JA7 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
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CHSY3Q70JA7 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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