Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.83□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.86□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
XRCC4Q13426 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
XRCC4Q13426 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
XRCC4Q13426 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
XRCC4Q13426 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
XRCC4Q13426 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
XRCC4Q13426 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
XRCC4Q13426 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
XRCC4Q13426 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
XRCC4Q13426 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
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