Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ERVPABLB-1P60509 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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ERVPABLB-1P60509 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ERVPABLB-1P60509 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
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