Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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HOXD1Q9GZZ0 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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HOXD1Q9GZZ0 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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HOXD1Q9GZZ0 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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HOXD1Q9GZZ0 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
HOXD1Q9GZZ0 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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HOXD1Q9GZZ0 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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HOXD1Q9GZZ0 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HOXD1Q9GZZ0 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HOXD1Q9GZZ0 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
HOXD1Q9GZZ0 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HOXD1Q9GZZ0 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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HOXD1Q9GZZ0 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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HOXD1Q9GZZ0 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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HOXD1Q9GZZ0 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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HOXD1Q9GZZ0 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXD1Q9GZZ0 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXD1Q9GZZ0 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXD1Q9GZZ0 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXD1Q9GZZ0 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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