Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
E2F4Q16254 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
E2F4Q16254 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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