Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
FOXE3Q13461 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXE3Q13461 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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