Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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GTF3C1Q12789 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
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