Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Speer3W4VSP1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms