Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc166S4R181 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms