Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Mrpl40Q9Z2Q5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Mrpl40Q9Z2Q5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Mrpl40Q9Z2Q5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Mrpl40Q9Z2Q5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Mrpl40Q9Z2Q5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Mrpl40Q9Z2Q5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms